NPIDB: Pfam family PF00476.22

Home Browse Download Help About Us

List of complexes

Pfam families

SCOP families

Interaction classes

Interaction modes

GO terms

Domains of Pfam family DNA_pol_A (PF00476.22

)

Domain ID	Uniprot AC	Species	Begin-End	#Structures	Interaction modes
A0QYZ2_529-905	A0QYZ2	Mycolicibacterium smegmatis	529-905	2	H-Bb H-Mj H-Mn S-Bb L-Bb L-Mn
D9N168_200-577	D9N168	Geobacillus stearothermophilus	200-577	12	H-Bb H-Mj H-Mn S-Bb L-Bb L-Mn H-Bb H-Mn S-Bb L-Bb L-Mj L-Mn H-Bb H-Mn S-Bb L-Bb L-Mn
E1C9K5_201-578	E1C9K5	Geobacillus stearothermophilus	201-578	29	H-Bb H-Mj H-Mn L-Bb L-Mn H-Bb H-Mj H-Mn S-Bb L-Bb L-Mj L-Mn H-Bb H-Mj H-Mn S-Bb L-Bb L-Mn H-Bb H-Mj L-Bb L-Mj L-Mn H-Bb H-Mn S-Bb L-Bb L-Mj L-Mn H-Bb H-Mn S-Bb L-Bb L-Mn
O75417_2096-2584	O75417	Homo sapiens	2096-2584	6	H-Bb H-Mn L-Bb L-Mn * H-Bb L-Bb L-Mn *
P00581_316-702	P00581	Enterobacteria phage T7	316-702	23	H-Bb H-Mj H-Mn L-Bb L-Mn H-Bb H-Mj H-Mn S-Bb L-Bb L-Mj L-Mn H-Bb H-Mj H-Mn S-Bb L-Bb L-Mn H-Bb H-Mn S-Bb L-Bb L-Mj L-Mn H-Bb H-Mn S-Bb L-Bb L-Mn H-Bb S-Bb L-Bb L-Mj L-Mn H-Bb S-Bb L-Bb L-Mn H-Bb S-Bb S-Mj S-Mn L-Bb L-Mn * L-Bb L-Mn *
P00581_326-702	P00581	Enterobacteria phage T7	326-702	5	H-Bb S-Bb L-Bb L-Mn *
P00582_549-926	P00582	Escherichia coli	549-926	12	H-Bb S-Bb L-Bb L-Mj *
P19821_441-643	P19821	Thermus aquaticus	441-643	1	H-Bb H-Mn S-Bb L-Bb L-Mn
P19821_453-829	P19821	Thermus aquaticus	453-829	72	H-Bb H-Mj H-Mn S-Bb L-Bb L-Mj L-Mn H-Bb H-Mj H-Mn S-Bb L-Bb L-Mn H-Bb H-Mn S-Bb L-Bb L-Mj L-Mn H-Bb H-Mn S-Bb L-Bb L-Mn H-Bb S-Bb L-Bb L-Mn
P19821_639-772	P19821	Thermus aquaticus	639-772	1	H-Bb H-Mn S-Bb L-Mn
P52026_497-874	P52026	Geobacillus stearothermophilus	497-874	33	H-Bb H-Mj H-Mn S-Bb L-Bb L-Mj L-Mn H-Bb H-Mj H-Mn S-Bb L-Bb L-Mn H-Bb H-Mn S-Bb L-Bb L-Mj L-Mn H-Bb H-Mn S-Bb L-Bb L-Mn
P54098_755-1188	P54098	Homo sapiens	755-1188	5	H-Bb L-Bb L-Mn * H-Bb S-Bb L-Bb L-Mn *
Q45458_497-874	Q45458	Geobacillus stearothermophilus	497-874	6	H-Bb H-Mj H-Mn S-Bb L-Bb L-Mn H-Bb H-Mn S-Bb L-Bb L-Mj L-Mn H-Bb H-Mn S-Bb L-Bb L-Mn H-Bb S-Bb L-Bb L-Mn
Q5KWC1_499-876	Q5KWC1	Geobacillus kaustophilus	499-876	46	H-Bb H-Mj H-Mn S-Bb L-Bb L-Mj L-Mn H-Bb H-Mj H-Mn S-Bb L-Bb L-Mn H-Bb H-Mn S-Bb L-Bb L-Mj L-Mn H-Bb H-Mn S-Bb L-Bb L-Mn H-Bb S-Bb L-Bb L-Mn
Q7Z5Q5_447-854	Q7Z5Q5	Homo sapiens	447-854	4	H-Bb H-Mj H-Mn L-Bb L-Mj * H-Bb H-Mj H-Mn S-Bb L-Bb L-Mj L-Mn H-Bb H-Mn L-Bb L-Mj L-Mn *

Interaction class: H-Bb H-Mn S-Bb L-Mn

* interaction modes not found in water-containing structures resolved with X-RAY DIFFRACTION method having resolution better than 3 Angstrom

© NPIDB team 2003 - 2021

text