Show specific contacts
Show all contacts
Hide all contacts
[ Download ]

Nucleic atom dist Protein atom
DC6:M.OP1/1 3.14 ARG159:A.NH1/1
DC6:M.OP1/1 3.19 VAL242:A.N/1
DC6:M.OP2/1 2.99 ARG159:A.NH2/1
DT7:M.OP2/1 2.98 SER257:A.N/1
DT7:M.OP2/1 2.66 SER257:A.OG/1
DG10:M.N7/1 2.87 LYS43:A.NZ/1
DT11:M.OP2/1 2.37 SER47:A.OG/1
DT11:M.OP2/1 2.71 ARG50:A.NH2/1
DA12:M.OP1/1 2.85 ARG81:A.NH1/1
DA12:M.OP2/1 3.25 ARG81:A.NH2/1
DA12:M.N3/1 2.64 ARG282:A.NH2/1
DT13:M.OP2/1 2.79 ALA84:A.N/1
DT13:M.OP2/1 2.63 THR87:A.OG1/1
DT13:M.O4/1 2.75 GLN90:A.NE2/1
DA14:M.OP1/1 2.84 LYS132:A.N/1
DA14:M.O5'/1 2.78 LYS86:A.NZ/1
DG15:M.OP1/1 2.94 GLN133:A.NE2/1
DG15:M.OP2/1 2.96 ARG326:A.NH1/1
DG15:M.OP2/1 2.99 ARG326:A.NH2/1
DC16:M.OP1/1 2.9 ARG292:A.NE/1
DC16:M.OP1/1 2.85 ARG292:A.NH2/1
DC16:M.OP2/1 2.8 TRP315:A.NE1/1
DT4:N.OP2/1 2.28 ARG121:A.NH2/1
DG5:N.OP1/1 3.16 ARG106:A.NE/1
DG5:N.OP2/1 3.17 ASN96:A.ND2/1
DC6:N.OP1/1 2.74 ARG100:A.NH2/1
DC6:N.OP2/1 3.25 ARG100:A.NH1/1
DT7:N.OP2/1 2.9 SER38:A.N/1
DT7:N.OP2/1 2.53 THR41:A.OG1/1
DT7:N.O4/1 3.19 GLN90:A.NE2/1
DA8:N.OP2/1 3.18 SER38:A.OG/1
DA8:N.OP2/1 2.87 HIS40:A.ND1/1
DA8:N.O3'/1 2.96 ARG173:A.NH1/1
DT9:N.OP1/1 2.85 ALA175:A.N/1
DA10:N.OP1/1 2.65 SER287:A.OG/1
DA10:N.OP1/1 3.13 HIS289:A.N/1
DA10:N.OP2/1 2.47 GLU262:A.OE2/1
DA10:N.OP2/1 2.83 GLY288:A.N/1
DA10:N.O4'/1 3.36 ARG282:A.NH1/1
DC11:N.OP1/1 2.57 TYR283:A.N/1
DG12:N.OP1/1 3.09 LYS276:A.NZ/1
DG12:N.N7/1 2.98 ARG259:A.NH2/1
DG12:N.O6/1 2.93 ARG259:A.NE/1
DT17:N.O2/1 2.64 ARG243:A.NH1/1
DA18:N.O4'/1 2.95 ARG243:A.NH1/1
DT19:N.O2/1 2.34 LYS244:A.NZ/1
DC6:M.OP1/2 3.14 ARG159:A.NH1/2
DC6:M.OP1/2 3.19 VAL242:A.N/2
DC6:M.OP2/2 2.99 ARG159:A.NH2/2
DT7:M.OP2/2 2.98 SER257:A.N/2
DT7:M.OP2/2 2.66 SER257:A.OG/2
DG10:M.N7/2 2.87 LYS43:A.NZ/2
DT11:M.OP2/2 2.37 SER47:A.OG/2
DT11:M.OP2/2 2.71 ARG50:A.NH2/2
DA12:M.OP1/2 2.85 ARG81:A.NH1/2
DA12:M.OP2/2 3.25 ARG81:A.NH2/2
DA12:M.N3/2 2.64 ARG282:A.NH2/2
DT13:M.OP2/2 2.79 ALA84:A.N/2
DT13:M.OP2/2 2.63 THR87:A.OG1/2
DT13:M.O4/2 2.75 GLN90:A.NE2/2
DA14:M.OP1/2 2.84 LYS132:A.N/2
DA14:M.O5'/2 2.78 LYS86:A.NZ/2
DG15:M.OP1/2 2.94 GLN133:A.NE2/2
DG15:M.OP2/2 2.96 ARG326:A.NH1/2
DG15:M.OP2/2 2.99 ARG326:A.NH2/2
DC16:M.OP1/2 2.9 ARG292:A.NE/2
DC16:M.OP1/2 2.85 ARG292:A.NH2/2
DC16:M.OP2/2 2.8 TRP315:A.NE1/2
DT4:N.OP2/2 2.28 ARG121:A.NH2/2
DG5:N.OP1/2 3.16 ARG106:A.NE/2
DG5:N.OP2/2 3.17 ASN96:A.ND2/2
DC6:N.OP1/2 2.74 ARG100:A.NH2/2
DC6:N.OP2/2 3.25 ARG100:A.NH1/2
DT7:N.OP2/2 2.9 SER38:A.N/2
DT7:N.OP2/2 2.53 THR41:A.OG1/2
DT7:N.O4/2 3.19 GLN90:A.NE2/2
DA8:N.OP2/2 3.18 SER38:A.OG/2
DA8:N.OP2/2 2.87 HIS40:A.ND1/2
DA8:N.O3'/2 2.96 ARG173:A.NH1/2
DT9:N.OP1/2 2.85 ALA175:A.N/2
DA10:N.OP1/2 2.65 SER287:A.OG/2
DA10:N.OP1/2 3.13 HIS289:A.N/2
DA10:N.OP2/2 2.47 GLU262:A.OE2/2
DA10:N.OP2/2 2.83 GLY288:A.N/2
DA10:N.O4'/2 3.36 ARG282:A.NH1/2
DC11:N.OP1/2 2.57 TYR283:A.N/2
DG12:N.OP1/2 3.09 LYS276:A.NZ/2
DG12:N.N7/2 2.98 ARG259:A.NH2/2
DG12:N.O6/2 2.93 ARG259:A.NE/2
DT17:N.O2/2 2.64 ARG243:A.NH1/2
DA18:N.O4'/2 2.95 ARG243:A.NH1/2
DT19:N.O2/2 2.34 LYS244:A.NZ/2
DC6:M.OP1/3 3.14 ARG159:A.NH1/3
DC6:M.OP1/3 3.19 VAL242:A.N/3
DC6:M.OP2/3 2.99 ARG159:A.NH2/3
DT7:M.OP2/3 2.98 SER257:A.N/3
DT7:M.OP2/3 2.66 SER257:A.OG/3
DG10:M.N7/3 2.87 LYS43:A.NZ/3
DT11:M.OP2/3 2.37 SER47:A.OG/3
DT11:M.OP2/3 2.71 ARG50:A.NH2/3
DA12:M.OP1/3 2.85 ARG81:A.NH1/3
DA12:M.OP2/3 3.25 ARG81:A.NH2/3
DA12:M.N3/3 2.64 ARG282:A.NH2/3
DT13:M.OP2/3 2.79 ALA84:A.N/3
DT13:M.OP2/3 2.63 THR87:A.OG1/3
DT13:M.O4/3 2.75 GLN90:A.NE2/3
DA14:M.OP1/3 2.84 LYS132:A.N/3
DA14:M.O5'/3 2.78 LYS86:A.NZ/3
DG15:M.OP1/3 2.94 GLN133:A.NE2/3
DG15:M.OP2/3 2.96 ARG326:A.NH1/3
DG15:M.OP2/3 2.99 ARG326:A.NH2/3
DC16:M.OP1/3 2.9 ARG292:A.NE/3
DC16:M.OP1/3 2.85 ARG292:A.NH2/3
DC16:M.OP2/3 2.8 TRP315:A.NE1/3
DT4:N.OP2/3 2.28 ARG121:A.NH2/3
DG5:N.OP1/3 3.16 ARG106:A.NE/3
DG5:N.OP2/3 3.17 ASN96:A.ND2/3
DC6:N.OP1/3 2.74 ARG100:A.NH2/3
DC6:N.OP2/3 3.25 ARG100:A.NH1/3
DT7:N.OP2/3 2.9 SER38:A.N/3
DT7:N.OP2/3 2.53 THR41:A.OG1/3
DT7:N.O4/3 3.19 GLN90:A.NE2/3
DA8:N.OP2/3 3.18 SER38:A.OG/3
DA8:N.OP2/3 2.87 HIS40:A.ND1/3
DA8:N.O3'/3 2.96 ARG173:A.NH1/3
DT9:N.OP1/3 2.85 ALA175:A.N/3
DA10:N.OP1/3 2.65 SER287:A.OG/3
DA10:N.OP1/3 3.13 HIS289:A.N/3
DA10:N.OP2/3 2.47 GLU262:A.OE2/3
DA10:N.OP2/3 2.83 GLY288:A.N/3
DA10:N.O4'/3 3.36 ARG282:A.NH1/3
DC11:N.OP1/3 2.57 TYR283:A.N/3
DG12:N.OP1/3 3.09 LYS276:A.NZ/3
DG12:N.N7/3 2.98 ARG259:A.NH2/3
DG12:N.O6/3 2.93 ARG259:A.NE/3
DT17:N.O2/3 2.64 ARG243:A.NH1/3
DA18:N.O4'/3 2.95 ARG243:A.NH1/3
DT19:N.O2/3 2.34 LYS244:A.NZ/3
Show specific contacts
Show all contacts
Hide all contacts
[ Download ]
Nucleic atom d_n2w water d_p2w Protein atom
DA4:M.N3/1 2.94 409:A/1 2.85 LYS244:A.N/1
DA5:M.OP1/1 2.58 261:M/1 2.76 LYS244:A.O/1
DA5:M.O3'/1 3.23 361:A/1 2.4 ARG241:A.NE/1
DA5:M.N3/1 2.83 403:A/1 2.55 ARG241:A.NH2/1
DA5:M.N3/1 2.83 403:A/1 3.18 ARG243:A.NH1/1
DC6:M.OP2/1 2.58 187:M/1 3.01 VAL242:A.O/1
DT11:M.OP1/1 2.72 171:M/1 2.82 SER47:A.O/1
DA12:M.OP2/1 2.71 71:M/1 2.8 HIS91:A.NE2/1
DT13:M.OP1/1 2.66 548:A/1 2.57 GLY82:A.O/1
DA14:M.OP1/1 2.83 537:A/1 2.78 LYS132:A.NZ/1
DA14:M.OP2/1 2.73 36:M/1 3 LYS86:A.N/1
DG15:M.OP1/1 2.86 345:A/1 2.85 ALA134:A.N/1
DG15:M.OP2/1 3.12 531:A/1 2.66 ASN323:A.OD1/1
DC16:M.OP1/1 2.6 62:M/1 3.29 HIS289:A.NE2/1
DC16:M.OP2/1 2.85 386:A/1 2.76 ILE320:A.O/1
DT2:N.OP2/1 2.49 521:A/2 3.04 ASN317:A.ND2/2
DG5:N.OP1/1 2.73 503:A/1 2.48 ARG100:A.NH1/1
DA8:N.OP2/1 2.74 439:A/1 2.39 SER38:A.OG/1
DA8:N.OP2/1 2.74 439:A/1 2.74 HIS40:A.N/1
DT9:N.OP2/1 2.8 408:A/1 2.77 THR258:A.OG1/1
DA10:N.OP1/1 3 91:N/1 3.06 TYR283:A.OH/1
DA10:N.N3/1 2.29 250:N/1 3.13 ARG282:A.NE/1
DA10:N.N3/1 2.29 250:N/1 2.75 ARG282:A.NH2/1
DC11:N.OP1/1 2.78 242:N/1 3.03 LYS276:A.NZ/1
DC11:N.OP1/1 2.78 242:N/1 2.97 LEU284:A.N/1
DC11:N.OP1/1 2.76 308:N/1 2.77 ALA285:A.O/1
DC11:N.OP2/1 2.76 308:N/1 2.77 ALA285:A.O/1
DC11:N.O4'/1 2.79 250:N/1 3.13 ARG282:A.NE/1
DC11:N.O4'/1 2.79 250:N/1 2.75 ARG282:A.NH2/1
DC11:N.N4/1 2.96 367:A/1 2.85 GLU262:A.OE1/1
DG12:N.OP2/1 2.92 534:A/1 2.77 ARG259:A.NH2/1
DG12:N.OP2/1 2.92 534:A/1 3.13 GLU266:A.OE1/1
DT16:N.O2/1 2.75 558:A/1 2.74 ARG241:A.NH2/1
DA18:N.N3/1 2.82 357:A/1 2.61 ARG243:A.NH1/1
DT19:N.OP1/1 2.82 520:A/1 2.45 ASN245:A.ND2/1
DT19:N.O3'/1 2.96 127:N/1 3.25 ASN245:A.N/1
DA4:M.N3/2 2.94 409:A/2 2.85 LYS244:A.N/2
DA5:M.OP1/2 2.58 261:M/2 2.76 LYS244:A.O/2
DA5:M.O3'/2 3.23 361:A/2 2.4 ARG241:A.NE/2
DA5:M.N3/2 2.83 403:A/2 2.55 ARG241:A.NH2/2
DA5:M.N3/2 2.83 403:A/2 3.18 ARG243:A.NH1/2
DC6:M.OP2/2 2.58 187:M/2 3.01 VAL242:A.O/2
DT11:M.OP1/2 2.72 171:M/2 2.82 SER47:A.O/2
DA12:M.OP2/2 2.71 71:M/2 2.8 HIS91:A.NE2/2
DT13:M.OP1/2 2.66 548:A/2 2.57 GLY82:A.O/2
DA14:M.OP1/2 2.83 537:A/2 2.78 LYS132:A.NZ/2
DA14:M.OP2/2 2.73 36:M/2 3 LYS86:A.N/2
DG15:M.OP1/2 2.86 345:A/2 2.85 ALA134:A.N/2
DG15:M.OP2/2 3.12 531:A/2 2.66 ASN323:A.OD1/2
DC16:M.OP1/2 2.6 62:M/2 3.29 HIS289:A.NE2/2
DC16:M.OP2/2 2.85 386:A/2 2.76 ILE320:A.O/2
DT2:N.OP2/2 2.49 521:A/3 3.04 ASN317:A.ND2/3
DG5:N.OP1/2 2.73 503:A/2 2.48 ARG100:A.NH1/2
DA8:N.OP2/2 2.74 439:A/2 2.39 SER38:A.OG/2
DA8:N.OP2/2 2.74 439:A/2 2.74 HIS40:A.N/2
DT9:N.OP2/2 2.8 408:A/2 2.77 THR258:A.OG1/2
DA10:N.OP1/2 3 91:N/2 3.06 TYR283:A.OH/2
DA10:N.N3/2 2.29 250:N/2 3.13 ARG282:A.NE/2
DA10:N.N3/2 2.29 250:N/2 2.75 ARG282:A.NH2/2
DC11:N.OP1/2 2.78 242:N/2 3.03 LYS276:A.NZ/2
DC11:N.OP1/2 2.78 242:N/2 2.97 LEU284:A.N/2
DC11:N.OP1/2 2.76 308:N/2 2.77 ALA285:A.O/2
DC11:N.OP2/2 2.76 308:N/2 2.77 ALA285:A.O/2
DC11:N.O4'/2 2.79 250:N/2 3.13 ARG282:A.NE/2
DC11:N.O4'/2 2.79 250:N/2 2.75 ARG282:A.NH2/2
DC11:N.N4/2 2.96 367:A/2 2.85 GLU262:A.OE1/2
DG12:N.OP2/2 2.92 534:A/2 2.77 ARG259:A.NH2/2
DG12:N.OP2/2 2.92 534:A/2 3.13 GLU266:A.OE1/2
DT16:N.O2/2 2.75 558:A/2 2.74 ARG241:A.NH2/2
DA18:N.N3/2 2.82 357:A/2 2.61 ARG243:A.NH1/2
DT19:N.OP1/2 2.82 520:A/2 2.45 ASN245:A.ND2/2
DT19:N.O3'/2 2.96 127:N/2 3.25 ASN245:A.N/2
DA4:M.N3/3 2.94 409:A/3 2.85 LYS244:A.N/3
DA5:M.OP1/3 2.58 261:M/3 2.76 LYS244:A.O/3
DA5:M.O3'/3 3.23 361:A/3 2.4 ARG241:A.NE/3
DA5:M.N3/3 2.83 403:A/3 2.55 ARG241:A.NH2/3
DA5:M.N3/3 2.83 403:A/3 3.18 ARG243:A.NH1/3
DC6:M.OP2/3 2.58 187:M/3 3.01 VAL242:A.O/3
DT11:M.OP1/3 2.72 171:M/3 2.82 SER47:A.O/3
DA12:M.OP2/3 2.71 71:M/3 2.8 HIS91:A.NE2/3
DT13:M.OP1/3 2.66 548:A/3 2.57 GLY82:A.O/3
DA14:M.OP1/3 2.83 537:A/3 2.78 LYS132:A.NZ/3
DA14:M.OP2/3 2.73 36:M/3 3 LYS86:A.N/3
DG15:M.OP1/3 2.86 345:A/3 2.85 ALA134:A.N/3
DG15:M.OP2/3 3.12 531:A/3 2.66 ASN323:A.OD1/3
DC16:M.OP1/3 2.6 62:M/3 3.29 HIS289:A.NE2/3
DC16:M.OP2/3 2.85 386:A/3 2.76 ILE320:A.O/3
DT2:N.OP2/3 2.49 521:A/1 3.04 ASN317:A.ND2/1
DG5:N.OP1/3 2.73 503:A/3 2.48 ARG100:A.NH1/3
DA8:N.OP2/3 2.74 439:A/3 2.39 SER38:A.OG/3
DA8:N.OP2/3 2.74 439:A/3 2.74 HIS40:A.N/3
DT9:N.OP2/3 2.8 408:A/3 2.77 THR258:A.OG1/3
DA10:N.OP1/3 3 91:N/3 3.06 TYR283:A.OH/3
DA10:N.N3/3 2.29 250:N/3 3.13 ARG282:A.NE/3
DA10:N.N3/3 2.29 250:N/3 2.75 ARG282:A.NH2/3
DC11:N.OP1/3 2.78 242:N/3 3.03 LYS276:A.NZ/3
DC11:N.OP1/3 2.78 242:N/3 2.97 LEU284:A.N/3
DC11:N.OP1/3 2.76 308:N/3 2.77 ALA285:A.O/3
DC11:N.OP2/3 2.76 308:N/3 2.77 ALA285:A.O/3
DC11:N.O4'/3 2.79 250:N/3 3.13 ARG282:A.NE/3
DC11:N.O4'/3 2.79 250:N/3 2.75 ARG282:A.NH2/3
DC11:N.N4/3 2.96 367:A/3 2.85 GLU262:A.OE1/3
DG12:N.OP2/3 2.92 534:A/3 2.77 ARG259:A.NH2/3
DG12:N.OP2/3 2.92 534:A/3 3.13 GLU266:A.OE1/3
DT16:N.O2/3 2.75 558:A/3 2.74 ARG241:A.NH2/3
DA18:N.N3/3 2.82 357:A/3 2.61 ARG243:A.NH1/3
DT19:N.OP1/3 2.82 520:A/3 2.45 ASN245:A.ND2/3
DT19:N.O3'/3 2.96 127:N/3 3.25 ASN245:A.N/3
[ Download ]
Core number Atoms Action

  Hbonds:

Hbonds service shows hydrogen bonds on the NA-protein interface. One H-bond is one line in the table, where:
 Nucleic atom is atom of nucleic acid in Jmol/RasMol format.
 Protein atom is atom of protein in Jmol/RasMol format.
 Dist is distance from nucleic atom to protein atom in angstroms (Å).

  W-Bridges:

W-Bridges service shows Water-bridges on the NA-protein interface. One Water-bridge is one line in the table, where:
 Nucleic atom is atom of nucleic acid in Jmol/RasMol format.
 Protein atom is atom of protein in Jmol/RasMol format.
 Water is water molecule.
 d_n2w is distance from nucleic atom to water molecule (Å).
 d_p2w is distance from protein atom to water molecule (Å).

  CluD:

CluD service shows hydrophobic clusters on the NA-protein interface. One Cluster is one line in the table, where:
 Core number is serial number of cluster.
 Atoms is number of detected atoms in the cluster.
© NPIDB team 2003 - 2021

text